Die Abteilung Therapien vereinigt Massnahmen ausserhalb des Standardstundenplans, die darauf abzielen einen bestehenden Entwicklungsrückstand in einem schulischen Teilbereich auszugleichen. Dazu gehören die logopädische Therapie, die psychomotorische Therapie, die Psychotherapie und die Audiopädagogik.

Die Leitung der Abteilung Therapien verteilt die nach kantonalen Vorgaben gesprochenen Ressourcen auf die Schulen der Stadt Winterthur, sorgt für deren fachgerechte Verwendung, stellt Therapeutinnen und Therapeuten an und betreut diese.